Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms