Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms