Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Usp29Q9ES63 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Usp29Q9ES63 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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