Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Klhdc9Q3USL1 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms