Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprtQ99M80 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms