Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc38Q8CDN8 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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