Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Ccdc18Q640L5 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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