Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms