Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Fam160a2-208ENSMUST00000179474 10853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
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PtprmP28828 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
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PtprmP28828 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
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PtprmP28828 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
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