Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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