Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms