Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M5A7VMS3 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms