Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Speer3W4VSP1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms