Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria3Q9Z2W9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms