Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms