Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms