Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Padi1Q9Z185 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi1Q9Z185 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi1Q9Z185 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi1Q9Z185 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi1Q9Z185 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi1Q9Z185 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi1Q9Z185 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi1Q9Z185 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi1Q9Z185 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi1Q9Z185 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi1Q9Z185 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi1Q9Z185 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi1Q9Z185 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms