Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rspo1Q9Z132 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo1Q9Z132 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms