Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms