Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms