Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx1Q9WV80 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx1Q9WV80 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms