Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms