Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn8aQ9WTU3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn8aQ9WTU3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms