Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggps1Q9WTN0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggps1Q9WTN0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms