Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms