Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTL2

Rab25, Ras-related protein Rab-25, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab25Q9WTL2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab25Q9WTL2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab25Q9WTL2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab25Q9WTL2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab25Q9WTL2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab25Q9WTL2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab25Q9WTL2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab25Q9WTL2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab25Q9WTL2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab25Q9WTL2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab25Q9WTL2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab25Q9WTL2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab25Q9WTL2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms