Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hic1Q9R1Y5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hic1Q9R1Y5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hic1Q9R1Y5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hic1Q9R1Y5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hic1Q9R1Y5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hic1Q9R1Y5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hic1Q9R1Y5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hic1Q9R1Y5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hic1Q9R1Y5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hic1Q9R1Y5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hic1Q9R1Y5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms