Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf4Q9QZS2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms