Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms