Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rdh11Q9QYF1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh11Q9QYF1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rdh11Q9QYF1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rdh11Q9QYF1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rdh11Q9QYF1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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