Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms