Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pcsk1nQ9QXV0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms