Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms