Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apbb1Q9QXJ1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms