Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms