Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms