Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms