Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb1Q9JLC3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msrb1Q9JLC3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms