Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms