Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms