Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms