Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem3Q9JKE1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms