Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp5Q9JKD3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms