Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tuba8Q9JJZ2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tuba8Q9JJZ2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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