Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx20Q9JJY4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ddx20Q9JJY4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ddx20Q9JJY4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ddx20Q9JJY4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddx20Q9JJY4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddx20Q9JJY4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddx20Q9JJY4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddx20Q9JJY4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddx20Q9JJY4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddx20Q9JJY4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddx20Q9JJY4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddx20Q9JJY4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddx20Q9JJY4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms