Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Efcc1Q9JJF6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms