Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc86Q9JJ89 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms