Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pus3Q9JI38 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms