Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RabggtaQ9JHK4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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