Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmod3Q9JHJ0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms